PyMOL

Οι ανάγκες της επιστήμης πυροδότησαν την ανάπτυξη του ηλεκτρονικού υπολογιστή, ο οποίος οδήγησε στον υπολογιστή και στον σημερινό κόσμο που βασίζεται στα πολυμέσα. Έκτοτε επιστράφηκε η χάρη: τα τρισδιάστατα γραφικά έχουν φέρει επανάσταση στην επιστημονική απεικόνιση. Θα χρειαστείτε μια ερευνητική υποτροφία για να αντέξετε οικονομικά τα περισσότερα επιστημονικά εργαλεία, και ένα προηγμένο πτυχίο για να τα χρησιμοποιήσετε. Αλλά όλο και περισσότερο λογισμικό ποιοτικής έρευνας εμφανίζεται σε προσιτές τιμές. Τώρα το DeLano Scientific έχει ανεβάσει τα επίπεδα μειώνοντας το κόστος των ποιοτικών επιστημονικών εργαλείων στο χρηματικό ισοδύναμο του Απόλυτου Μηδενός: όπως στο "δωρεάν". Το PyMOL του είναι μια δωρεάν μηχανή μοριακής προβολής ανοιχτού κώδικα, εργαλείο απόδοσης και πρόγραμμα επεξεργασίας που μπορεί να απεικονίσει την τρισδιάστατη μοριακή δομή μέχρι το ατομικό επίπεδο, συμπεριλαμβανομένης της κρυσταλλογραφικής δομής ακτίνων Χ πρωτεϊνών, DNA, RNA, υδατανθράκων, μεταβολιτών, σακχάρων και πολλών περισσότερο. Θα αποδώσει επίσης καλλιτεχνικές απεικονίσεις γεωμετρικών μορφών, διαδραστικές απεικονίσεις και κινούμενες οθόνες. Τρέχει σε Windows, Mac OS, Linux και Unix.

Η χρήση του PyMOL είναι εκπληκτικά εύκολη, ακόμα κι αν δεν έχετε γνώσεις χημείας. Η διεπαφή είναι καλά σχεδιασμένη και αρκετά διαισθητική, λαμβάνοντας υπόψη την εσωτερική λειτουργία του προγράμματος. Ωστόσο, υπάρχει άφθονη βοήθεια και πραγματικά εκτεταμένη τεκμηρίωση, συμπεριλαμβανομένου του πηγαίο κώδικα, στον ιστότοπο του προϊόντος, όπου υπάρχουν ακόμη και σύνδεσμοι για εντυπωσιακές επιδείξεις YouTube. Οι μοριακές προσομοιώσεις είναι διασκεδαστικές, αλλά είναι αρκετά καλές για μια επιστημονική εκπομπή PBS. Το PyMOL είναι ένα σοβαρό επιστημονικό εργαλείο που υποστηρίζεται από μια αποκλειστική κοινότητα ανοιχτού κώδικα.

Το PyMOL πραγματοποιεί λήψη ως συμπιεσμένο αρχείο και αφήνει πίσω τους φακέλους όταν το απεγκαθιστάτε. Υποστηρίζει εκδόσεις 64-bit των Windows.