POY

Περιγραφή

Το POY είναι ένα πρόγραμμα φυλογενετικής ανάλυσης που υποστηρίζει πολλαπλά είδη δεδομένων (π.χ. μορφολογία, νουκλεοτίδια, γονίδια και περιοχές γονιδίων, χρωμοσώματα και ολόκληρα γονιδιώματα). Το POY είναι ιδιαίτερο στο ότι μπορεί να εκτελέσει πραγματική ευθυγράμμιση και συμπέρασμα φυλογένεσης, δηλαδή οι ακολουθίες εισόδου δεν χρειάζεται να είναι προ-ευθυγραμμισμένες. Οι εισαγωγές, οι διαγραφές και οι αναδιατάξεις μπορούν στη συνέχεια να συμπεριληφθούν στη συνολική βαθμολογία δέντρου κάτω από τη Μέγιστη παρρησία ή στο μοντέλο στην περιοχή Μέγιστη πιθανότητα. Μια ποικιλία ευρετικών αλγορίθμων έχουν αναπτυχθεί για το σκοπό αυτό και υλοποιούνται στο POY.