Pedimap

Περιγραφή

Το Pedimap είναι ένα εργαλείο για την εξερεύνηση και την οπτικοποίηση της ροής φαινοτύπων και αλληλόμορφων (παρατηρούμενων ή βασισμένων σε υπολογισμούς Identity-by-Descent) μέσω γενεαλογικών γενεαλογιών. Διαθέτει εργαλεία για τη χειροκίνητη και αυτόματη επιλογή τμημάτων της γενεαλογίας με βάση κριτήρια όπως οι πρόγονοι και/ή οι απόγονοι σε έναν καθορισμένο αριθμό γενεών, κατά μήκος της μητρικής, πατρικής ή και των δύο γραμμών, αδερφών κ.λπ. Για κάθε επιλογή μπορούν να υπάρχουν πολλαπλές προβολές δημιουργείται για να εμφανίζει διαφορετικές ομάδες σύνδεσης, φαινοτυπικά χαρακτηριστικά κ.λπ. Μόλις δημιουργηθεί μια προβολή για μια επιλογή, μπορεί να αναδημιουργηθεί αυτόματα για οποιαδήποτε άλλη επιλογή. Το Pedimap μπορεί να ασχοληθεί με αριθμητικές και κειμενικές φαινοτυπικές βαθμολογίες, καθώς και με πολυπλοειδή καθώς και διπλοειδή. Οι γενετικές πληροφορίες μπορούν να εμφανιστούν σύμφωνα με χάρτες γενετικής σύνδεσης, εξ ου και το όνομα.