proTRAC

Περιγραφή

Το proTRAC είναι ένα μοναδικό και εύχρηστο εργαλείο για πιθανολογική ανίχνευση, οπτικοποίηση και ανάλυση συστάδων piRNA. Το proTRAC παρουσιάζει υψηλότερη ευαισθησία και επιλεκτικότητα σε σύγκριση με τις μέχρι τώρα εφαρμοσμένες μεθόδους ανίχνευσης συστάδων. Η σημασία της πυκνότητας χτυπήματος ανάγνωσης της παρατηρούμενης ακολουθίας, η μεροληψία κλώνου, η ποσότητα των τόπων που αντιστοιχούν σε σπάνια χαρτογραφημένες αναγνώσεις αλληλουχίας, η ποσότητα των τόπων με Τ στη θέση 1 ή Α στη θέση 10 και η ποσότητα των τόπων εντός του τυπικού εύρους μήκους piRNA (26- 32nt) λαμβάνονται υπόψη. Τα παρατηρούμενα χαρακτηριστικά των υποψηφίων συστάδων αξιολογούνται υπό το πρίσμα του δεδομένου συνόλου δεδομένων και υπόκεινται σε ένα πιθανό σύστημα βαθμολόγησης.