GenoSuite
| Εκδοχή | 2.0.1 |
|---|---|
| Εκδότης | Dhirendra Kumar |
| Ημερομηνία κυκλοφορίας | 2 Μαΐ 2013 |
| Ημερομηνία προστέθηκε | 2 Μαΐ 2013 |
| Απαιτήσεις Os | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Απαιτήσεις | None |
| Σύνολο λήψεων | 22 |
| Τιμή | Free |
Περιγραφή
Το GenoSuite είναι ένα πλαίσιο που αναπτύχθηκε για την πρωτεογονιδιωματική ανάλυση. Η στρατηγική που βασίζεται στο FDRScore χρησιμοποιείται για την ενσωμάτωση αποτελεσμάτων από πολλαπλούς αλγόριθμους αναζήτησης. Το Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) αναπτύχθηκε ως μέρος του πλαισίου GenoSuite. Το PPT προορίζεται για την εύρεση νέων μεταφράσεων σε προκαρυωτικά γονιδιώματα και εξαρτάται από πρωτεομικά δεδομένα με βάση τη Φασματομετρία Μάζας και τη σχετική αλληλουχία γονιδιώματος. Τα χαρακτηριστικά περιλαμβάνουν τη διαμόρφωση για 4 αλγόριθμους ανοιχτού κώδικα για την εκτέλεση αναζήτησης βάσης δεδομένων για αναγνώριση πεπτιδίου και μπορεί να επιλεγεί οποιοσδήποτε συνδυασμός των 4 αλγορίθμων, παραθέτει τα συγκεκριμένα πεπτίδια αναζήτησης γονιδιώματος (Νέα πεπτίδια), φασματικές αντιστοιχίσεις μπορούν να οπτικοποιηθούν για την αξιολόγηση ποιότητας, παραθέτει μπορούν επίσης να δημιουργηθούν οι νέες πρωτεΐνες και οι αλλαγές στους υπάρχοντες σχολιασμούς πρωτεϊνών και ένα οπτικό γονιδιωματικό πλαίσιο των νέων πεπτιδίων.
