compsort for Mac

Περιγραφή

Εργαλείο γραμμής εντολών για σύγκριση αρχείων δεδομένων οριοθετημένα με κόμμα, χρησιμοποιώντας σχετικές διαφορές για τον προσδιορισμό των πιο όμοιων διαμορφώσεων. Το Compsort συγκρίνει τα αρχεία δεδομένων χρησιμοποιώντας σχετική διαφορά, υπολογίζει μια βαθμολογία ομοιότητας, ταξινομεί τις βαθμολογίες σε αύξουσα σειρά (οι χαμηλότερες τιμές αντιπροσωπεύουν μεγαλύτερη ομοιότητα), αποθηκεύει Χ αριθμό χαμηλών βαθμολογιών.

Τα αρχεία δεδομένων που παράγονται από τον χρήστη, πρέπει να είναι αρχεία κειμένου οριοθετημένα με κόμμα. Κάθε αρχείο αντιπροσωπεύει ένα μοναδικό μόριο. Κάθε σειρά σε ένα αρχείο αντιπροσωπεύει μια μοναδική διαμόρφωση του μορίου. Η πρώτη στήλη στο αρχείο δεδομένων πρέπει να είναι μια ετικέτα μοναδική για τη διαμόρφωση που αντιπροσωπεύεται από τη σειρά. Οι υπόλοιπες στήλες είναι αριθμητικοί περιγραφείς, όπως μετρήσεις χώρου απόστασης.

Οι σειρές συγκρίνονται συνδυαστικά μεταξύ αρχείων. Οι ετικέτες σε σύγκριση συνενώνονται και αποθηκεύονται με τις βαθμολογίες για το σύνολο των σειρών. Αυτό παρέχει έναν τρόπο αναγνώρισης των διαμορφώσεων που παρήγαγαν μια δεδομένη βαθμολογία ομοιότητας.

Οι μελλοντικές εργασίες περιλαμβάνουν:

προσθήκη διεπαφής GUI

ανάρτηση χαρτιού στον τρισδιάστατο αλγόριθμο μοντελοποίησης φαρμακοφόρου

Μια παράλληλη έκδοση που χρησιμοποιεί MPI